飼養箱的選擇：飼養箱應選擇具有足夠活動空間的類型，同時要確保能夠阻止小鼠啃咬磨牙咬破鼠盒而逃逸。飼養箱應該是透明的，以便于觀察小鼠的活動和健康狀況。飼養箱的側壁應設有出入口和通風口，以便于小鼠進出和空氣流通。
溫度和濕度控制：小鼠飼養環境的溫度應控制在18-26℃之間，相對濕度應在40%-70%之間。飼養箱內溫度比環境高1-2℃，濕度高5%-10%。可以通過使用加熱器、空調或加濕器等設備來控制飼養箱內的溫度和濕度。
墊料的選擇：墊料應具有強吸濕性、無毒、無刺激氣味、無粉塵、不可食、便于保暖與做窩，并使動物感到舒適。墊料必須經過消毒滅菌處理，以去除潛在的病原體和有害物質。一般飼料以闊葉林木的刨花或鋸末為宜，切忌用針葉木（松、栓、杉）刨花做墊料。
飼料和飲水：小鼠應飼喂全價營養顆粒飼料，不同種類的小鼠有不同的營養標準，且飼料中應含一定比例的粗纖維，使成型飼料具有一定的硬度，以便小鼠磨牙。同時應維持營養成分的相對穩定，任何飼料配方或劑型的改變都要作為重大問題記入檔案。飲水器可使用玻璃瓶、塑料瓶，瓶塞上裝有金屬或玻璃飲水管，容量一般為250ml或500ml。
清潔衛生和消毒：每周應至少更換兩次墊料。換墊料時將飼養盒一起移去，在專門的房間倒墊料，可以防止室內的灰塵和污染。一級以上動物的墊料在使用前應經高壓消毒滅菌。要保持飼養室內外整潔，門窗、墻壁、地面等無塵土。堅持每月小消毒和每季度大消毒一次的制度。即每月用0.1%新潔爾滅噴霧空氣消毒一次，室外用3%來蘇爾消毒，每季度用過氧乙酸（0.2%）噴霧消毒鼠舍一次。籠具、食具至少每月c底消毒一次，鼠舍內其它用具也應隨用隨消毒。
動物健康的外觀檢查：這是檢查動物健康狀況的一項常規工作。外觀判斷小鼠健康的標準是：食欲旺盛；眼睛有神，反應敏捷；體毛光滑，肌肉豐滿，活動有力；身無傷痕，尾不彎曲，天然孔腔無分泌物，無畸形；糞便黑色呈麥粒狀
性別鑒別：成年鼠性別很易區分，雄鼠的陰囊明顯；雌鼠可見陰道開口和五對乳頭。幼鼠或仔鼠則主要從外生殖器與g門的距離判定，近者為雌，遠者為雄。